Lin-4
lin-4是最早發現的microRNA,1993年由維克托·安布羅斯等人在模式生物秀麗隱桿線蟲的基因組中發現。 [1][2] 這是第一個被發現的miRNA,是一類參與基因調控的非編碼核糖核酸。[3] miRNA轉錄形成70鹼基的前體後由Dicer酶切割形成21鹼基的產物[4]。 髮夾結構前體的範圍一般不為人所知,是根據髮夾結構預測來估計的。這些產物被認為通過與mRNA完全或部分互補而發揮調節作用。已發現lin-4基因位於一個單獨宿主基因lho-1的 4.11kb 內含子內(參見[1])。
lin-4 microRNA precursor | |
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預測的lin-4二級結構和保守序列 | |
識別符 | |
代號 | lin-4 |
Rfam | RF00052 |
miRBase | MI0000002 |
miRBase | MIPF0000303 |
其他數據 | |
RNA類型 | Gene; miRNA |
域 | Eukaryota |
轉錄
編輯lin-4由自主miRNA啟動子轉錄,並受發育調控,lin-4 miRNA積累發生在胚胎後發育的L2階段。 此外,在lin-4成熟形式出現時,內源性lin-4 初級轉錄本也會上調。[5] lin-4位於秀麗隱杆線蟲的II號染色體上,與lin-14 mRNA 的3' 非轉譯區 (UTR)中的序列互補,該互補轉錄本含有7個結合位點以及9個核苷酸核心元素CUCAGGGAA。lin-4:lin-14雙鏈體呈現出一種不尋常的扭結結構,這是由於鹼基對不匹配導致凹槽尺寸和鹼基堆積發生變化所致。[5] 該lin-4:lin-14對與秀麗隱杆線蟲中的IGF-1通路有關,與其發育的改變有關。[6]
發育影響
編輯lin-4決定線蟲幼蟲發育事件的開始。 lin-4功能喪失(lf)突變會導致發育遲緩,從最初的早期階段到後期的幼蟲階段。後果包括異時期(heterochrony)發育模式,如外陰和成蟲角質層結構的喪失。[1]lin-4是lin-14的負性調節因子[7][8],抑制LIN-14蛋白質的累積。[9]它也以lin-28為目標,並透過轉譯抑制來降低其蛋白質的表達。[10]lin-4與目標之間的鹼基配對是不連續的,由兩個短螺旋組成。[11]
參考文獻
編輯- ^ 1.0 1.1 Lee RC, Feinbaum RL, Ambros V. The C. elegans heterochronic gene lin-4 encodes small RNAs with antisense complementarity to lin-14.. Cell. 1993, 75 (5): 843–854. PMID 8252621. doi:10.1016/0092-8674(93)90529-Y .
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- ^ 5.0 5.1 Balasubramanian C, Ojha RP, Maiti S, Desideri A. Sampling the structure of the noncanonical lin-4:lin-14 microRNA:mRNA complex by molecular dynamics simulations.. J Phys Chem B. 2010, 114 (49): 16443–9. PMID 21090710. doi:10.1021/jp104193r.
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- ^ Ambros V. A hierarchy of regulatory genes controls a larva-to-adult developmental switch in C. elegans.. Cell. 1989, 57 (1): 49–57. PMID 2702689. doi:10.1016/0092-8674(89)90171-2.
- ^ Olsen PH, Ambros V. The lin-4 regulatory RNA controls developmental timing in Caenorhabditis elegans by blocking LIN-14 protein synthesis after the initiation of translation.. Dev Biol. 1999, 216 (2): 671–80. PMID 10642801. doi:10.1006/dbio.1999.9523 .
- ^ Bagga S, Bracht J, Hunter S, Massirer K, Holtz J, Eachus R, et al. Regulation by let-7 and lin-4 miRNAs results in target mRNA degradation.. Cell. 2005, 122 (4): 553–63. PMID 16122423. doi:10.1016/j.cell.2005.07.031 .
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