- 商朝地屬南疆，故稱南巢；《尚書·仲虺之誥》：「成湯放桀於南巢」。周朝時為巢（伯）國地；春秋時為楚屬國；巢國多次被吳所占，周元王四年（前472年），越滅吳，巢國還楚。秦統一後置郡縣，今柘皋一帶為橐皋縣，今巢湖以南為居巢縣，也作居鄛，兩縣均屬九江郡。東漢末年，居巢為曹操占據，此後隸屬曹魏。西晉在原居巢境內分設居巢、臨湖、襄安，隸屬廬江郡。隋開皇元年（581年），襄安屬廬江郡；《隋書·地理志》：襄安「有龜山、紫微山、亞父山、半陽山、白石山、四鼎山」；至此，今巢湖市東、西、北方位大致形成。
- 唐武德七年（624年），合開城、扶陽兩縣為巢縣（巢縣一名此始，一說改襄安為巢縣），隸屬廬州。北宋太平興國三年（978年）巢縣屬無為軍。南宋景定三年（1262年）升巢縣為鎮巢軍。元至元二十三年（1286年）稱巢州，二十八年（1291年）置巢州為縣，巢縣縣名至改置巢湖市前一直未變。
- 民國3年（1914年）屬安徽省安慶道。民國28年（1939年）由屬第三專區改第五專區。民國36年（1947年）4月到38年（1949年）1月，屬安徽省第九行政督察專員公署。民國38年（1949年）1月，屬新成立的江淮第五專員公署；6月，撤銷皖西專署及江淮第五專署，成立巢湖專員公署，巢縣隸屬之。
- 1949年4月，巢縣屬皖北行署區巢湖專區，1952年，巢湖、宣城兩專區合併成立蕪湖專區，巢縣屬蕪湖專區，1958年屬合肥市，1961年4月復屬蕪湖專區。1965年5月，經國務院批覆，巢湖專區於同年7月25日恢復，治巢縣城關，巢縣隸屬之。1971年8月（一說3月），巢湖專區改稱巢湖地區行政公署，巢縣隸屬不變。
- 1982年11月，以巢縣的部分地區設縣級巢湖市，屬巢湖地區。1983年10月，巢縣撤銷併入巢湖市。1999年7月9日，國務院正式批准撤銷巢湖地區，設立地級巢湖市，撤銷縣級巢湖市，設立居巢區。1999年12月6日巢湖市居巢區舉行揭牌儀式。2011年8月，國務院正式批覆安徽省關於拆解巢湖市分別劃歸合肥市、蕪湖市和馬鞍山市的決定，撤銷居巢區，改設縣級巢湖市。[1]
