山東都指揮使司，明朝十六個都指揮使司之一。
洪武元年（1368年）四月置山東等處行中書省。治濟南府。洪武三年（1370年）十二月置青州都衛。治青州府。洪武八年（1375年）十月改都衛為山東都指揮使司。洪武九年（1376年）六月改山東行中書省為承宣布政使司。山東都指揮使司屬於左軍都督府。
青州護衛（革）、兗州護衛（革）、兗州左護衛（後為臨清衛）、登州衛、青州左衛、萊州衛、寧海衛、濟南衛、平山衛、德州衛（後改屬後府）、樂安千戶所（後改名武定，屬後府）、膠州千戶所、諸城千戶所、滕縣千戶所
後來改制：
- 登州衛、青州左衛、萊州衛、寧海衛、濟南衛、平山衛、安東衛
- 原有青州右護衛，後改天津右衛
- 原有貴州護衛，革
- 添設：靈山衛、鰲山衛、大嵩衛、威海衛、成山衛、靖海衛、東昌衛、臨清衛（原兗州左護衛，後改）、任城衛、濟寧衛（原武昌左護衛，後改）、兗州護衛、膠州千戶所、諸城千戶所、滕縣千戶所、肥城千戶所
- 添設：海陽千戶所、東平千戶所、寧津千戶所、雄崖千戶所、浮山前千戶所、福山中前千戶所、奇山千戶所、濮州千戶所、金山左千戶所、尋山後千戶所、百尺崖後千戶所、王徐寨前千戶所、夏河寨前千戶所、魯府儀衛司、德府儀衛司、涇府儀衛司、衡府儀衛司、德府群牧所、涇府群牧所、衡山群牧所
