已测序真核生物基因组列表
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已测序真核生物基因组列表包括所有已知的，可以公开获取已组装、注释和发表的细胞核和细胞器基因组序列的真核生物；基因组草图不包括在内，只有细胞器序列的物种也不包括。
1977年，第一次出现DNA测序。1995年，细菌流感嗜血杆菌第一个完成了全基因组序列。1996年，酿酒酵母是第一个发布的真核生物基因组序列。1998年，发布了第一个多细胞真核生物基因组序列，秀丽隐杆线虫。
原生生物
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植物
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| 物种学名 | 类型 | 意义 | 基因组大小 | 预测的基因数 | 完成机构 | 完成年份 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| Arabidopsis thaliana 生态型:哥伦比亚 |
拟南芥 | 模式植物 | 119 Mb | 25,498,[1] 27,400,[2] 31,670 (UniProt) | Arabidopsis Genome Initiative[3] | 2000[1] |
| Cyanidioschyzon merolae Strain:10D |
红藻 | 单细胞真核生物 | 16.5 Mb | 5,331[4] | University of Tokyo, Rikkyo University, Saitama University and Kumamoto University | 2004[4] |
| Oryza sativassp ssp indica |
大米 | Crop and model organism | 420 Mb | 32-50,000[5] | Beijing Genomics Institute、浙江大学、中国科学院 | 2002[5] |
| Ostreococcus tauri | 绿藻 | 单细胞真核生物，基因组较小 | 12.6 Mb | 7,969 (UniProt) | Laboratoire Arago | 2006[6] |
| Populus trichocarpa | Balsam poplar or Black Cottonwood | 固碳模式植物，商业木材and comparison to A. thaliana | 550 Mb | 45,555[7] | The International Poplar Genome Consortium | 2006[7] |
真菌
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| 物种 | 纲 | 意义 | 基因组大小 | 预测基因数目 | 完成机构 | 完成年份 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 釀酒酵母 Saccharomyces cerevisiae 品系：S288C |
酵母菌綱 | 用于酿造啤酒的酵母；常用的模式生物 | 12.1 Mb | 6,294[8] | 大规模国际合作项目[9] | 1996[8] |
| 家兔脑胞内原虫 Encephalitozoon cuniculi |
微孢子蟲纲 | 人类病原体 | 2.9 Mb | 1,997[10] | Genoscope和Université Blaise Pascal | 2001[10] |
| 粟酒裂殖酵母 Schizosaccharomyces pombe 品系：972h- |
裂殖酵母纲 | 模式生物 | 14 Mb | 4,824[11] | 桑格研究所和冷泉港實驗室 | 2002[11] |
| 粉色麵包黴菌 Neurospora crassa |
糞殼菌綱 | 模式生物 | 40 Mb | 10,082[12] | Broad Institute、俄勒岡健康與科學大學、肯塔基大学和堪萨斯大学 | 2003[12] |
| 黄孢原毛平革菌 Phanerochaete chrysosporium 品系：RP78 |
傘菌綱 | 木材腐朽真菌；常用于真菌修復 | 30Mb | 11,777[13] | Joint Genome Institute | 2004[13] |
动物
编辑以下是最早的5个完成基因组测序的动物，更完整的列表，请参阅已测序动物基因组列表。
| 物种 | 类型 | 意义 | 基因组大小 | 预测的基因数目 | 完成机构 | 完成年份 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 秀麗隱桿線蟲 Caenorhabditis elegans 品系：Bristol N2 |
线虫动物门 | 模式动物 | 100 Mb | 19,000[14] | 华盛顿大学和维康桑格研究所 | 1998[14] |
| 黑腹果蝇 Drosophila melanogaster |
果蝇 | 模式动物 | 165 Mb | 13,600[15] | 塞雷拉基因組公司、加利福尼亞大學柏克萊分校、貝勒醫學院、欧洲DGP | 2000[15] |
| 甘比亞瘧蚊 Anopheles gambiae 品系：PEST |
蚊子 | 疟疾的载体 | 278 Mb | 13,683[16] | 塞雷拉基因組公司和法国国家基因测序中心 | 2002[16] |
| 红鳍东方鲀 Takifugu rubripes |
四齒魨科 | 脊椎动物中的最小基因组 | 390 Mb | 22–29,000[17] | 国际河豚基因体协会[18] | 2002[19] |
| 智人 Homo sapiens |
哺乳动物 | 3.2 Gb[20] | 18,826（CCDS估计） | 人类基因组计划委员会和塞雷拉基因組公司 | 草图：2001[21][22] 完成：2006[23] |
参见
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参考资料
编辑- ^ 1.0 1.1 The Arabidopsis Genome Initiative,. Analysis of the genome sequence of the flowering plant Arabidopsis thaliana. Nature. December 2000, 408 (6814): 796–815. PMID 11130711. doi:10.1038/35048692.
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外部链接
编辑- Diark - a resource for eukaryotic genome research （页面存档备份，存于互联网档案馆）
- EMBL-EBL Eukaryotic Genomes
- UCSC Genome Browser （页面存档备份，存于互联网档案馆）
- International Sequencing Consortium - Large-scale Sequencing Project Database （页面存档备份，存于互联网档案馆）
- Ensembl （页面存档备份，存于互联网档案馆） The Ensembl Genome Browser (includes draft and low coverage genomes)
- Fungal Genome Initiative （页面存档备份，存于互联网档案馆） (includes draft genomes)
- GOLD:Genomes OnLine Database v 3.0 （页面存档备份，存于互联网档案馆）
- SUPERFAMILY comparative genomics database （页面存档备份，存于互联网档案馆） Includes genomes of all completely sequenced eukaryotes, and sophisticated datamining plus visualisation tools for analysis
- Rat Genome Database （页面存档备份，存于互联网档案馆）