周仲孙(?—?),字元孙,东晋汝南郡安成县(今河南省汝南县东南)人,周访的孙子,周光的儿子。
晋哀帝兴宁初年,督宁州军事。为振武将军、宁州刺史。在宁州贪污暴虐,民不堪命。晋废帝太和六年(371年)再次监益州、豫州、梁州之三郡,益州刺史。晋孝武帝宁康初年,转镇梁益二州,前秦苻坚派仇池人杨安率众攻蜀,周仲孙兵败免官。後徵为光祿勳,死于任上。